Garvan Institute获得了用于基因组研究的新型超级计算机

戴尔EMC为Garvan医学研究所提供了一个新的HPC系统，以支持基因组研究和分析。Garvan医学研究所宣布将接收一种新的高性能计算(HPC)系统，以支持基因组研究和分析。基因组学是研究个体DNA中编码的信息，允许研究人员研究基因如何影响健康和疾病，研究所的使命是为医学研究做出重大贡献，这将改变科学和医学的方向并对其产生重大影响。人类健康。新的超级计算系统由戴尔EMC提供，将由Garvan的数据密集型计算机工程(DICE)小组使用。

Garvan研究所是澳大利亚最大的医学研究机构之一，专注于癌症，糖尿病和新陈代谢，基因组学和表观遗传学，免疫学和炎症，骨质疏松症和骨骼生物学以及神经科学的研究。

根据Garvan的Kinghorn临床基因组学中心的信息学主任Warren Kaplan博士的说法，基因组学需要大量的计算能力来分析数据。

“我们希望改变医学的方向，并对人们的健康产生改变生活的影响。我们认为基因组学是推动这种变革的关键，如果没有计算基础设施，我们就无法实现这一目标，”卡普兰说过。

另见：图片：世界上最快的25台超级计算机

(TechRepublic)

根据国家人类基因组研究所的数据，当第一个人类基因组测序时，1990年开始的项目耗时超过10年，耗资约27亿美元。

现在，Garvan每天可以以大约1,000美元的基本价格排序多达50个基因组。

为了有效地存储，分析和使用这种基因组信息，Garvan需要大量的计算资源和数据存储 - 每个人的基因组数据包含超过60亿个碱基和大约500万个遗传变体，需要700个小时才能处理。

“这项技术改变了我们科学的方式，”卡普兰继续说道。“这使我们能够将Garvan转变为数据驱动的医学研究机构，我们排序的基因组越多，我们就能越多地利用这些信息为未来的研究提供信息。”

该研究所表示，新系统预计将支持几个基因组数据集，包括悉尼基因组学协作和医学基因组参考库，并将有助于推动澳大利亚基因组癌症医学计划和其他计划。

DICE HPC系统基于戴尔EMC的第14代PowerEdge高性能计算技术构建。

该解决方案将在47台戴尔EMC PowerEdge服务器上为临床研究人员提供1,632个英特尔至强可扩展处理器内核的基因组处理能力。10个英特尔Arria 10 GX FPGA;122,880 Nvidia Tesla V100 CUDA核心;15,360个Nvidia Tensor核心，有望加速HPC和AI技术;744TB的NVMe加速基因组数据集的内存处理;41TB DDR4 RAM内存;和530TB可用容量CephFS存储