该剧场版重回柯南主线故事,柯南、降谷零、赤井秀一、琴酒、贝尔摩德等来自不同阵营的诸多人气角色登场,侦探和警方联手,与卷土重来的黑暗组织展开了一场比拼智力与武力的红黑大战。一段关于灰原哀的秘密往事也将在大银幕上首次揭开。