引物长短和特异性有关系吗（引物长度越长,到底是特异性增加还是减少呢?）

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引物长度越长,特异性增加。但是也要在一定范围内才正确。不是引物越长越好的。

“引物越长,能够配对的概率减少,所以特异性增加or引物越长,包含的碱基越多,发生错配的概率就越高”都对，是从问题的不同角度考量的。前者是从避免随机结合的角度看，后者是从碱基配对的精度上看。所以不能一刀切。

但是，就配对精度上来说，这个不是引物应该考虑的，因为任何一个碱基配对的时候都有可能出错，并且是独立事件。总体上看较长引物包含的碱基多，总概率增加，但是不代表每个碱基配对精度有改变。哪怕只有1BP的引物，还是存在错配的可能性。所以这个不是重点，重点是特异性。

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一般来说，1。引物长度要大于16BP，一般为20到24个最合适，因为4的16次方=4290000000，大于了哺乳动物单倍体基因组300000000的数量，可以防止随机结合了。

2。引物与靶序列间的Tm值不应该小于55度。小雨30BP的引物按照Tm=4（G+C）+2（A+T）来估计。

3。引物不应该有发卡结构，不能有4BP以上的回文序列

4。2个引物之间不应该有大于4BP的互补序列或者同源序列。在3`端不应该有任何互补碱基，避免引物二聚体。

4。碱基分布竟可能均匀，G+C接近50%

下着自此结系计根放名科算写。

要满足以上4个条件，难度随着引物长度增加而急剧加大。。。所以长度适中就好。一般来说，避免了随机结合就能保证其特异性了。

着业天通果，料品九改积。

本文到此结束，希望对大家有所帮助。